Cultivos Tropicales Vol. 47, No. 3, julio-septiembre 2026, ISSN: 1819-4087
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Artículo original

Aislamiento y caracterización de bacterias presentes en el cultivo de tejidos de Cenchrus purpureus CT-608

 

iDAmanda Abreu Cruz1Universidad Agraria de La Habana, A. Nacional, km 23 ½, San José de las Lajas, C.P. 32700, Mayabeque, Cuba

iDMaría Aurora Mesa Pérez1Universidad Agraria de La Habana, A. Nacional, km 23 ½, San José de las Lajas, C.P. 32700, Mayabeque, Cuba

iDMaibys Pérez Pérez1Universidad Agraria de La Habana, A. Nacional, km 23 ½, San José de las Lajas, C.P. 32700, Mayabeque, Cuba

iDMiriam Isidrón Pérez1Universidad Agraria de La Habana, A. Nacional, km 23 ½, San José de las Lajas, C.P. 32700, Mayabeque, Cuba

Andrés Raúl Hernández Montesinos2Instituto de Ciencia Animal, C. Central, km 47 ½, San José de las Lajas, Apartado Postal 24, Mayabeque, Cuba*✉:andresraulhm@gmail.com


1Universidad Agraria de La Habana, A. Nacional, km 23 ½, San José de las Lajas, C.P. 32700, Mayabeque, Cuba

2Instituto de Ciencia Animal, C. Central, km 47 ½, San José de las Lajas, Apartado Postal 24, Mayabeque, Cuba

 

*Autor para correspondencia: andresraulhm@gmail.com

Resumen

El objetivo del presente trabajo consistió en reportar los avances del aislamiento y caracterización de bacterias presentes en el cultivo de tejidos de Cenchrus purpureus CT-608. El estudio se desarrolló en el Laboratorio de Biotecnología de la Universidad Agraria de la Habana. Se empleó fragmentos de colonias de bacterias provenientes de microplantas contaminadas y se aislaron en tubos de ensayos con medio Agar Nutriente. Las colonias se describieron según sus características macroscópicas y microscópicas mediante tinción de Gram y microscopio óptico con aumento 1000X. Se evaluaron los descriptores: forma celular, forma de agrupación, tamaño, reacción a la tinción de Gram, producción de quistes, producción de cápsula, producción de endosporas. Se determinó la sensibilidad bacteriana al set de antibióticos: Pencillina, Amoxacillina, Ampicillina, Cefalexina, Cefixime, Ceftrioxima, Ácido nalidíxico, Gentamicina y Cloranfenicol. La respuesta a los antibióticos se realizó mediante la técnica de Kirby-Bauer. Se aislaron dos colonias bacterianas, donde se obtuvo un morfotipo Gram positivo (MF1) y dos morfotipos Gram negativo (MF2 y MF3) en una de las colonias. Predominó la forma celular bacilar, con tamaño de 3-4 mm y la forma de agrupación varió de bacilo a irregular arrocelada. Los morfotipos mostraron sensibilidad al Ácido nalidíxico y la Cefalexina, y resistencia a Penicillina, Amoxacillina y Ampicillina. Se aislaron tres morfotipos bacterianos en microplantas de C. purpureus CT-608 con características morfológicas y fisiológicas diversas. Su aparición tardía en el medio de cultivo y su circunscripción alrededor del explante indican que pueden tratarse de microorganismos endófitos, aspecto que debe ser comprobado mediante quimiotaxis.

Palabras clave: 
características macroscópicas y microscópicas, colonias, endófitos, morfotipos

Recibido: 25/10/2025; Aceptado: 19/3/2026

Conflicto de interés: Los autores declaran que no tienen conflicto de intereses.

Contribución de los autores: Conceptualización, Supervisión: María Aurora Mesa Pérez, Andrés Raúl Hernández Montesinos. Investigación: Amanda Abreu Cruz, María Aurora Mesa Pérez, Miriam Isidrón Pérez, Andrés Raúl Hernández Montesinos, Maibys Pérez Pérez. Metodología: Amanda Abreu Cruz, María Aurora Mesa Pérez, Andrés Raúl Hernández Montesinos. Redacción - borrador original, Redacción - revisión y edición: Amanda Abreu Cruz, María Aurora Mesa Pérez, Miriam Isidrón Pérez, Andrés Raúl Hernández Montesinos. Curación de datos: Amanda Abreu Cruz, Andrés Raúl Hernández Montesinos.

CONTENIDO

Introducción

 

El cultivo de tejidos vegetal es un método biotecnológico que permite producir plantas completas a partir de fragmentos de órganos y tejidos vegetales establecidos en condiciones ambientales controladas, con ausencia de microorganismos asociados, nutrición heterotrófica y recipientes de plástico o vidrio (11. Suárez, P. I. E. Prehistoria e historia del Cultivo de Tejidos Vegetales. En: Cultivo de Tejidos Vegetales. Suárez Padrón, I. E. (ed.). Ed. Colombia: Fondo Editorial Universidad de Córdoba; 2020. ISBN: 978-958-5104-09-9. pp 13-19. Available from: https://www.google.com/url?sa=t&source=web&rct=j&opi=89978449&url=https://repositorio.unicordoba.edu.co/entities/publication/800256e3-9997-4159-aae4-a0a2c5522852 ). Generalmente, la técnica de micropropagación se realiza en condiciones totalmente asépticas, por lo tanto, las bacterias se han descrito a menudo como contaminantes que pueden provocar la muerte de los tejidos vegetales, ya que compiten por los nutrientes y modifican el medio de cultivo (22. El-Banna, A. N., El-Mahrouk, M. E., Dewir, Y. H., Farid, M. A., Abou Elyazid, D. M. & Schumacher, H. M. Endophytic Bacteria in Banana In Vitro Cultures: Molecular Identification, Antibiotic Susceptibility, and Plant Survival. Horticulturae. 2021; 7(12): 526. Available from: https://doi.org/10.3390/horticulturae7120526 ,33. Romadanova, N. V., Tolegen, A. B., Kushnarenko, S. V., Zholdybayeva, E. V. & Bettoni, J. C. Effect of Plant Preservative Mixture TM on Endophytic Bacteria Eradication from in Vitro-Grown Apple Shoots. Plants. 2022; 11(19): 2624. Available from: https://doi.org/10.3390/plants11192624 ). Sin embargo, debido al conocimiento actual sobre los beneficios de los microorganismos endófitos y las bacterias asociativas en la promoción del crecimiento y la inducción de tolerancia al estrés, ha aumentado el interés en su uso en algunas etapas de la micropropagación (44. Soumare, A., Diédhiou, A. G., Arora, N. K., Tawfeeq Al-Ani, L. K., Ngom, M., Fall, S., Hafidi, M., Ouhdouch, Y., Kouisni, L. & Sy, M.O. Potential Role and Utilization of Plant Growth Promoting Microbes in Plant Tissue Culture. Frontiers in Microbiology. 2021; 12: 649878. Available from: https://doi.org/10.3389/fmicb.2021.649878 ).

Cenchrus purpureus (Schumach.) Morrone, llamado hierba elefante, se cultiva en toda la región tropical y subtropical, debido a su alto potencial de acumulación de biomasa, valor nutritivo, vigor y persistencia, lo que la convierte en un forraje de elevada demanda para la alimentación de especies rumiantes (55. Nguyen, B. T., Le, L. B., Pham, L. P., Nguyen, H. T., Tran, T. D. & Van Thai, N. The effects of biochar on the biomass yield of elephant grass (Pennisetum purpureum Schumach) and properties of acidic soils. Industrial Crops and Products. 2021; 161: 113224. Available from: https://doi.org/10.1016/j.indcrop.2020.113224 ). Se ha reportado que esta planta tiene el potencial de asociarse con microorganismos promotores del crecimiento, incluyendo las bacterias diazotróficas endófitas (66. Vander, P. A., de Andrade Lira, M., Machado, J. C., de Miranda Gomide, C. A., Martins, C. E., da Silva Lédo, F. J. & Daher, R. F. Elephantgrass, a tropical grass for cutting and grazing. Revista Brasileira de Ciencias Agrarias. 2021; 16(3): 1-13. Available from: https://doi.org/10.5039/agraria.v16i3a9317 ). En este sentido, se han aislado de las raíces de esta especie cuatro géneros bacterianos: Sphingomonas, Bacillus, Pantoea y Enterobacter, asociados a la disminución del estrés salino y promoción del crecimiento vegetal (77. Li, X., Geng, X., Xie, R., Fu, L., Jiang, J., Gao, L. & Sun, J. The endophytic bacteria isolated from elephant grass (Pennisetum purpureum Schumach) promote plant growth and enhance salt tolerance of hybrid Pennisetum. Biotechnology for Biofuels. 2016; 9: 190. Available from: https://doi.org/10.1186/s13068-016-0592-0 ).

En la actualidad se desarrollan ensayos para optimizar la micropropagación de C. purpureus CT-608 mediante segmentos de plantas cultivadas in vitro. Como primer paso se realizaron experimentos de desinfección y estableciendo in vitro, y seguido se efectuaron estudios para regenerar plántulas por organogénesis directa en el cual se encontraron bacterias asociadas a las microplantas. En la literatura consultada son escasas las investigaciones en las que se describan los géneros y especies de bacterias presentes en el cultivo de tejidos de C. purpureus. Por lo que, el objetivo del siguiente estudio es reportar los avances en el aislamiento y caracterización de bacterias presentes en el cultivo de tejidos de C. purpureus CT-608.

Materiales y Métodos

 

El siguiente estudio se desarrolló en las instalaciones de cultivo de tejidos vegetales pertenecientes al Laboratorio de Biotecnología de la Facultad de Agronomía de la Universidad Agraria de la Habana (UNAH), San José de las Lajas, Mayabeque, Cuba.

Material biológico

 

Consistió en bacterias detectadas en plántulas de C. purpureus CT-608 cultivadas in vitro, obtenidas del segundo subcultivo en experimentos de regeneración. Las plantas se encontraban establecidas en tubos de ensayo con 15 mL de medio de cultivo, en condiciones controladas en cámara de crecimiento con fotoperíodo de 16 h de iluminación y 8 h de oscuridad, humedad relativa de 70 ± 5 %, intensidad lumínica de 45 μmol m-2 s-1 y temperatura de 25 ± 2 °C.

Aislamiento de bacterias

 

Se extrajo un fragmento de la colonia directamente del tubo de ensayo contaminado y se cultivó en tubos de ensayos con 15 mL de medio Agar Nutriente compuesto por 5,0 g L de peptona bacteriológica, 1,0 g L de extracto nutritivo, 2,0 g L de extracto de levadura, 5,0 g L de cloruro de sodio y 15,0 g L de agar, y se le ajustó el pH a 5,7. Después de realizada la siembra se colocaron los tubos en incubación durante 48 h a 30 ± 2 °C.

Descripción de las colonias bacterianas

 

Posterior al aislamiento se procedió con la descripción macroscópica de forma visual, para ello se determinó la forma, color, superficie y borde de las colonias de bacterias según lo propuesto en el Manual de Bacteriología de Bergey (88. Brenner, D. J., Staley, J. T. & Krieg, N. R. Classification of Procaryotic Organisms and the Concept of Bacterial Speciation. In: Brenner, D.J., Krieg, N.R., Staley, J.T., Garrity, G.M. (eds) Bergey’s Manual® of Systematic Bacteriology. Springer, Boston, MA; 2005. pp 27-32. Available from: https://doi.org/10.1007/0-387-28021-94 ). Seguido se realizó la descripción microscópica para determinar la morfología de las colonias mediante tinción de Gram. Para ello se evaluaron los siguientes descriptores: forma celular, forma de agrupación, tamaño, reacción a la tinción de Gram, producción de quistes, producción de cápsula, producción de endosporas. Las observaciones se realizaron en microscopio óptico con aumento 1000X.

Antibiograma

 

se determinó la sensibilidad bacteriana al set de antibióticos: Penicillina, Amoxacillina, Ampicillina, Cefalexina, Cefixime, Ceftrioxima, Ácido nalidíxico, Gentamicina y Cloranfenicol. La respuesta a los antibióticos se realizó mediante la técnica de Kirby-Bauer o difusión en disco (99. Kirby, W. M. M., Bauer, A. W., Sherris, J. C. & Turck, M. Antibiotic susceptibility testing by a standardized single disk method. American Journal of Clinical Pathology. 1966; 45(4): 493-496. Available from: https://doi.org/10.1093/ajcp/45.4_ts.493 ). Para ello, las colonias bacterianas subcultivadas en placa de Petri con medio Agar Nutriente se suspendieron hasta lograr una turbidez estándar de 0,5 en la escala de Mc Farland y se incubaron durante 24 h. Pasado este tiempo se colocaron cinco discos, por placa, impregnados en antibióticos con una separación mínima de 24 mm para evitar interferencias y se incubaron durante 24 h a 35 ± 2 oC. Se evaluó el ancho del halo de inhibición incluyendo el disco en milímetros (mm) y se comparó con la tabla de puntos de corte Eucast para clasificarlas en sensibles, indiferentes o resistentes.

Resultados y Discusión

 

Se aislaron dos colonias bacterianas que aparecieron alrededor de los 30 días de la fase de multiplicación en múltiples réplicas del cultivo in vitro de C. purpureum. Siempre se presentaron por separado en los tubos de ensayo y se circunscribía su crecimiento a la zona inmediata al explante sin colonizar el resto del medio, no obstante, su presencia no afectaba el desarrollo y crecimiento de las microplantas. Este resultado podría indicar que los microorganismos presentes son endófitos y por eso resisten los tratamientos de desinfección aplicados al explante.

Las bacterias en estudio se muestran en la (Figura 1A y 1B), al inicio se aislaron dos colonias (Figura 1C y 1D), las cuales se diferencian entre sí por sus características macroscópicas (Tabla 1). Al realizar la observación microscópica de los aislados se comprobó la existencia de dos morfotipos (MF) bacterianos en la colonia 1 y un morfotipo en la colonia 2. En la colonia 1 se procedió a su purificación mediante técnica de agotamiento para separar los morfotipos bacterianos aislados los cuales se identificaron como MF1 y MF2, y MF3 en la colonia 2.

La caracterización microscópica muestra un morfotipo Gram positivo (MF1) y dos morfotipos Gram negativo (MF2 y MF3) (Figura 1E y 1F). Predomina la forma bacilar, aunque MF3 presenta una típica forma irregular y arrocelada, típica del Phylum Firmicutes. No hay indicios de presencia de quistes, endosporas o cápsulas en ninguno de los morfotipos aislados. Los tres morfotipos son catalasa + con un marcado metabolismo aerobio (Tabla 2).

Figura 1.  A. Microplantas de C. purpureus CT-608 con crecimiento de las colonias de bacterianas (MF1-MF2). B. Microplantas de C. purpureus CT-608 con crecimiento de la colonia de bacteriana MF3. C. Bacterias aisladas en medio Agar Nutriente (MF1-MF2). D. Bacterias aisladas en medio Agar Nutriente (MF3). E. Características microscópicas de los morfotipos MF1 y MF2. F. Características microscópicas del morfotipo MF3.
Tabla 1.  Descripción macroscópica de los morfotipos presentes en las colonias bacterianas aisladas en medio Agar Nutriente
Características macroscópicas Colonias bacterianas
MF1 MF2 MF3
Comunes Tamaño mediano en 48 horas de crecimiento. Forma circular con tendencia a la irregularidad. Elevación difusa. Textura cremosa. Catalasa positiva.
Diferentes Borde ligeramente ondulado. Color amarillo intenso Borde ligeramente ondulado. Color amarillo tenue Borde entero. Color naranja intenso

Fuente: Elaborada por los autores

Tabla 2.  Características microscópicas de los morfotipos bacterianos aislados en medio Agar Nutriente
Características microscópicas Morfotipos de bacterias
MF1 MF2 MF3
Forma celular bacilar bacilar bacilar
Tamaño 3-4 mm 3-4 mm 3-4 mm
Forma de agrupación bacilo bacilo Irregular, arrocelada
Gram + - -

Fuente: Elaborada por los autores

El antibiograma mostró sensibilidad al Ácido nalidíxico y la Cefalexina (Rocephin) para los morfotipos MF1 y MF2, y resistencia a Penicillina, Amoxacillina y Ampicillina. El ensayo no se pudo realizar en el MF3, ya que no creció después del primer subcultivo, lo que implicó no poder aplicar los discos con antibióticos.

Algunos autores plantean que los microorganismos endófitos desarrollan parte de su ciclo de vida dentro de una planta (1010. Pérez, A. F., Pérez, C. R. & Chamorro, C. M. Bacterias endófitas asociadas a cultivo de arroz con actividad antimicrobiana sobre Burkholderia glumae. Revista de la Asociación Colombiana de Ciencias Biológicas. 2013; 25: 31-40. Available from: https://doi.org/10.24188/recia.v4.n1.2012.306. ). La mayoría colonizan diferentes compartimentos de la misma como el apoplasto, incluyendo los espacios intercelulares de las paredes y los vasos del xilema. Por otra parte, algunos investigadores refieren que los métodos de desinfección no siempre eliminan las poblaciones de microorganismos en los tejidos in vitro, muchos son capaces de permanecer latentes en haces conductores y quedan protegidos de los agentes químicos (1111. Chavarría, D. & López, G. Micropropagación de ápices caulinares en Plátano (Musa spp. AAB) cultivar Cuerno Gigante. (Doctoral Thesis Internet). Managua, Nicaragua: Universidad Nacional Agraria, UNA; 2010 (cited 2025 jul 18). Available from: https://repositorio.una.edu.ni/2138/1/tnf02c512m.pdf ). Además, existen factores que pueden incidir en la contaminación como son: la desinfección deficiente de los explantes, los problemas con la esterilización de los medios de cultivo, los contaminantes ambientales y las deficiencias en la manipulación de las áreas estériles.

Los análisis macro y microscópicos realizados para caracterizar los tres morfotipos bacterianos hallados son de gran importancia, ya que, en el caso del análisis macroscópico, permite determinar características específicas de las cepas, y constituye el método primario más común para la identificación de los fenotipos de las colonias (1212. Bou, G., Fernández-Olmos, A., García, C., Sáez-Niet, J. A. & Valdezate, S. Métodos de identificación bacteriana en el laboratorio de microbiología. Enfermedades Infecciosas y Microbiología Clínica. 2011; 29(8): 601-608. Available from: https://doi.org/10.1016/j.eimc.2011.03.012 ). De esta forma algunos autores expresan que este método se basa en las características macroscópicas observables de las colonias como su tamaño, tipo de colonia, textura, color y apariencia (1313. Mayea, S., Corone, M., Novo, R., Boado, I., Silveira, E., Soria, M. & Valiño, A. Microbiología Agropecuaria. Tomo II. Editorial Félix Varela. La Habana, Cuba; 2009. ISBN: 10-959-07-0576-6. pp 281. Available from: https://www.google.com/url?sa=t&source=web&rct=j&opi=89978449&url=https://www.isbncuba.ccl.cerlalc.org/catalogo.php%3Fmode%3Ddetalle%26nt%3D2567 ). Por otra parte, el análisis microscópico evidencia características claves para la identificación bacteriana como son el tipo de pared celular que presenta el microorganismo o la presencia de estructuras distintivas.

Dentro de estos métodos, la tinción de Gram, permite clasificar las bacterias basado en las diferencias en la composición de la pared celular. Al conocer si las bacterias son Gram positivo o negativo posibilita la toma de medidas adecuadas para identificar o incluso combatir bacterias en el caso de ser patógenas (1414. Yoshimura, J., Ogura, H. & Oda, J. Can Gram staining be a guiding tool for optimizing initial antimicrobial agents in bacterial infections?. Acute Medicine & Surgery. 2023; 10(1): e862. Available from: https://doi.org/10.1002/ams2.862.).

Los resultados de la observación al microscopio óptico determinaron el predominio de la forma bacilar en los morfotipos bacterianos. Las células bacterianas pueden variar en forma, y de acuerdo a ello se pueden clasificar en cocos (esféricos), bacilos (cilíndricos, forma varilla), espirilos (espirales o helicales), y filamentos (formas complejas). Conocer la forma de la célula nos brinda información sobre su supervivencia, actividad en el ambiente, y motilidad. En el caso de los bacilos, poseen un área superficial mayor a la tasa de volumen, y pueden obtener nutrientes más eficientes de soluciones diluidas (1515. Slonezewski, J. & Foster, J. Microbiology: An Evolving Science. Segunda Edición. Ed. W. W. Norton & Company, Estados Unidos; 2010. ISBN-10-0393934470. pp. 1097. Available from: https://www.google.com/url?sa=t&source=web&rct=j&opi=89978449&url=https://books.google.com/books/about/Microbiology.html%3Fid%3DDyK5RAAACAAJ ). Además, producen y liberan agua oxigenada (H2O2) y ácido láctico lo cual impide el desarrollo de otras formas bacterianas y de hongos (1616. Del Re, C. L., Rosenberg, C. E. & Madrid, V. G. Organismos procariotas y eucariotas. En: Biología celular y genética. Capítulo 3. Libros de Cátedra. Buenos Aires, Argentina: Universidad Nacional de La Plata (EDULP); 2025. ISBN: 978-950-34-2523-7. pp 36-49. Available from: https://sedici.unlp.edu.ar/bitstream/handle/10915/179578/Documento_completo.pdf?sequence=1 ).

El antibiograma mostró sensibilidad al Ácido nalidíxico y la Cefalexina para los morfotipos MF1 y MF2, y resistencia a Penicillina, Amoxacillina y Ampicillina. Las respuestas halladas es este ensayo son de gran importancia para trazar estrategias de desinfección combinadas con el Ácido nalidíxico o la Cefalexina. Los antibióticos son un subgrupo de antimicrobianos con actividad antibacteriana que causan la muerte o inhiben el crecimiento de bacterias y hongos en los medios de cultivo y plantas cultivadas in vitro (1717. Hernández, Y. & Gonzáles, M. Efecto de la contaminación Microbiana y Oxidación Fenólica en el Establecimiento In vitro de frutas perennes. Cultivos tropicales. 2010; 31(4): 58-69. Available from: https://ediciones.inca.edu.cu/index.php/ediciones/article/view/78 ). Sin embargo, es importante tener en cuenta que el inadecuado uso de los antibióticos es el principal impulsor de la resistencia bacteriana (1818. Klein, E.Y., Van Boeckel, T.P., Martinez, E.M., Pant, S., Gandra, S. & Levin, S.A. Global increase and geographic convergence in antibiotic consumption between 2000 and 2015. Proceedings of the National Academy of Sciences. 2018; 115(15): 3463-70. Available from: http://dx.doi.org/10.1073/pnas.1717295115 ), por lo que, es importante usar los antibióticos de manera responsable y en combinación con otras medidas de control, como la esterilización adecuada de los medios de cultivo, herramientas y equipos.

Antibióticos como el Ácido nalidíxico y la Ampicillina tienen actividad eficaz frente a un amplio espectro de bacterias Gram negativas (1919. Quetylas. F. & Azonzo J. Antibioticos β-lactamicos. En. Velásquez Farmacología Básica y Clínica. Madrid, España; 2015. ISBN: 978-84-9835-168-2. pp. 805-824. Available from: https://dialnet.unirioja.es/servlet/libro?codigo=312360 ). El Ácido nalidíxico es una quinolona que actúa en el interior de las bacterias y de la girasa del DNA, enzima esencial para el enrollamiento y superenrollamiento del DNA bacteriano, acción que impide su duplicación y favorece su rompimiento (2020. Castro, A. J. M. Estudio de la adsorción y degradación fotocatalítica de ácido nalidíxico con catalizador TiO2 Evonik P25. (Master Thesis internet). San Luis Potosí, México: Centro de Investigación y Estudios de Posgrado; 2023 (cited 2025 jul 18). Available from: https://repositorioinstitucional.uaslp.mx/xmlui/handle/i/8333 ). Por otra parte, la Penicillina, la Amoxacillina y la Ampicillina inhiben la reproducción, crecimiento, y provoca alargamiento y lisis de las bacterias susceptibles (2121. Martínez, F., Sigcha, E. & Toaquiza, P. Alternativa para la propagación in vitro de plátano variedad maqueño (Musa balbisiana AAB). Ciencia y Tecnología. 2008; 1(1): 43. Available from: https://doi.org/10.18779/cyt.v1i1.62 ).

Existen un grupo de bacilos Gram negativos que poseen enzimas que le confiere resistencia a Amoxacillina y Ampicillina, y algunas cefalosporinas de primera generación. Las cefalosporinas de segunda o tercera generación son estables a estas enzimas y pueden, por lo tanto, ser utilizadas como alternativa de tratamiento. Además, la resistencia de algunos bacilos Gram positivos está predominantemente asociada a cambios estructurales en la pared celular o en componentes citosólicos como los ribosomas y no a mecanismos enzimáticos, haciéndolos resistentes a Penicillina o cefalosporina (2222. Fica, C. A. Resistencia antibiótica en bacilos Gram negativos, cocáceas Gram positivas y anaerobios. Implicancias terapéuticas. Revista Médica Clínica Las Condes. 2014; 25(3): 432-444. Available from: https://doi.org/10.1016/S0716-8640(14)70060-4 ).

Conclusiones

 

Se aislaron tres morfotipos bacterianos en microplantas de C. purpureus CT-608 con características morfológicas y fisiológicas diversas, donde se determinó un morfotipo Gram positivo (MF1) y dos morfotipos Gram negativo (MF2 y MF3).

En los morfotipos MF1 y MF2 predomina la forma bacilar, aunque MF3 presenta una típica forma irregular y arrocelada, no hay indicios de presencia de quistes, endosporas o cápsulas en ninguno de los casos. Los tres morfotipos son catalasa + con un marcado metabolismo aerobio. El antibiograma mostró sensibilidad al Ácido nalidíxico y la Cefalexina (Rocephin) para los morfotipos MF1 y MF2, y resistencia a Penicillina, Amoxacillina y Ampicillina.

La aparición tardía de los morfotipos bacterianos en el medio de cultivo y su circunscripción alrededor del explante indican que pueden tratarse de microorganismos endófitos, aspecto que debe comprobarse mediante técnicas de quimiotaxis en ensayos posteriores.

Agradecimientos

 

A los colegas del Laboratorio de Biotecnología de la Facultad de Agronomía de la Universidad Agraria de la Habana.

Bibliografía

 

1. Suárez, P. I. E. Prehistoria e historia del Cultivo de Tejidos Vegetales. En: Cultivo de Tejidos Vegetales. Suárez Padrón, I. E. (ed.). Ed. Colombia: Fondo Editorial Universidad de Córdoba; 2020. ISBN: 978-958-5104-09-9. pp 13-19. Available from: https://www.google.com/url?sa=t&source=web&rct=j&opi=89978449&url=https://repositorio.unicordoba.edu.co/entities/publication/800256e3-9997-4159-aae4-a0a2c5522852

2. El-Banna, A. N., El-Mahrouk, M. E., Dewir, Y. H., Farid, M. A., Abou Elyazid, D. M. & Schumacher, H. M. Endophytic Bacteria in Banana In Vitro Cultures: Molecular Identification, Antibiotic Susceptibility, and Plant Survival. Horticulturae. 2021; 7(12): 526. Available from: https://doi.org/10.3390/horticulturae7120526

3. Romadanova, N. V., Tolegen, A. B., Kushnarenko, S. V., Zholdybayeva, E. V. & Bettoni, J. C. Effect of Plant Preservative Mixture TM on Endophytic Bacteria Eradication from in Vitro-Grown Apple Shoots. Plants. 2022; 11(19): 2624. Available from: https://doi.org/10.3390/plants11192624

4. Soumare, A., Diédhiou, A. G., Arora, N. K., Tawfeeq Al-Ani, L. K., Ngom, M., Fall, S., Hafidi, M., Ouhdouch, Y., Kouisni, L. & Sy, M.O. Potential Role and Utilization of Plant Growth Promoting Microbes in Plant Tissue Culture. Frontiers in Microbiology. 2021; 12: 649878. Available from: https://doi.org/10.3389/fmicb.2021.649878

5. Nguyen, B. T., Le, L. B., Pham, L. P., Nguyen, H. T., Tran, T. D. & Van Thai, N. The effects of biochar on the biomass yield of elephant grass (Pennisetum purpureum Schumach) and properties of acidic soils. Industrial Crops and Products. 2021; 161: 113224. Available from: https://doi.org/10.1016/j.indcrop.2020.113224

6. Vander, P. A., de Andrade Lira, M., Machado, J. C., de Miranda Gomide, C. A., Martins, C. E., da Silva Lédo, F. J. & Daher, R. F. Elephantgrass, a tropical grass for cutting and grazing. Revista Brasileira de Ciencias Agrarias. 2021; 16(3): 1-13. Available from: https://doi.org/10.5039/agraria.v16i3a9317

7. Li, X., Geng, X., Xie, R., Fu, L., Jiang, J., Gao, L. & Sun, J. The endophytic bacteria isolated from elephant grass (Pennisetum purpureum Schumach) promote plant growth and enhance salt tolerance of hybrid Pennisetum. Biotechnology for Biofuels. 2016; 9: 190. Available from: https://doi.org/10.1186/s13068-016-0592-0

8. Brenner, D. J., Staley, J. T. & Krieg, N. R. Classification of Procaryotic Organisms and the Concept of Bacterial Speciation. In: Brenner, D.J., Krieg, N.R., Staley, J.T., Garrity, G.M. (eds) Bergey’s Manual® of Systematic Bacteriology. Springer, Boston, MA; 2005. pp 27-32. Available from: https://doi.org/10.1007/0-387-28021-94

9. Kirby, W. M. M., Bauer, A. W., Sherris, J. C. & Turck, M. Antibiotic susceptibility testing by a standardized single disk method. American Journal of Clinical Pathology. 1966; 45(4): 493-496. Available from: https://doi.org/10.1093/ajcp/45.4_ts.493

10. Pérez, A. F., Pérez, C. R. & Chamorro, C. M. Bacterias endófitas asociadas a cultivo de arroz con actividad antimicrobiana sobre Burkholderia glumae. Revista de la Asociación Colombiana de Ciencias Biológicas. 2013; 25: 31-40. Available from: https://doi.org/10.24188/recia.v4.n1.2012.306.

11. Chavarría, D. & López, G. Micropropagación de ápices caulinares en Plátano (Musa spp. AAB) cultivar Cuerno Gigante. (Doctoral Thesis Internet). Managua, Nicaragua: Universidad Nacional Agraria, UNA; 2010 (cited 2025 jul 18). Available from: https://repositorio.una.edu.ni/2138/1/tnf02c512m.pdf

12. Bou, G., Fernández-Olmos, A., García, C., Sáez-Niet, J. A. & Valdezate, S. Métodos de identificación bacteriana en el laboratorio de microbiología. Enfermedades Infecciosas y Microbiología Clínica. 2011; 29(8): 601-608. Available from: https://doi.org/10.1016/j.eimc.2011.03.012

13. Mayea, S., Corone, M., Novo, R., Boado, I., Silveira, E., Soria, M. & Valiño, A. Microbiología Agropecuaria. Tomo II. Editorial Félix Varela. La Habana, Cuba; 2009. ISBN: 10-959-07-0576-6. pp 281. Available from: https://www.google.com/url?sa=t&source=web&rct=j&opi=89978449&url=https://www.isbncuba.ccl.cerlalc.org/catalogo.php%3Fmode%3Ddetalle%26nt%3D2567

14. Yoshimura, J., Ogura, H. & Oda, J. Can Gram staining be a guiding tool for optimizing initial antimicrobial agents in bacterial infections?. Acute Medicine & Surgery. 2023; 10(1): e862. Available from: https://doi.org/10.1002/ams2.862.

15. Slonezewski, J. & Foster, J. Microbiology: An Evolving Science. Segunda Edición. Ed. W. W. Norton & Company, Estados Unidos; 2010. ISBN-10-0393934470. pp. 1097. Available from: https://www.google.com/url?sa=t&source=web&rct=j&opi=89978449&url=https://books.google.com/books/about/Microbiology.html%3Fid%3DDyK5RAAACAAJ

16. Del Re, C. L., Rosenberg, C. E. & Madrid, V. G. Organismos procariotas y eucariotas. En: Biología celular y genética. Capítulo 3. Libros de Cátedra. Buenos Aires, Argentina: Universidad Nacional de La Plata (EDULP); 2025. ISBN: 978-950-34-2523-7. pp 36-49. Available from: https://sedici.unlp.edu.ar/bitstream/handle/10915/179578/Documento_completo.pdf?sequence=1

17. Hernández, Y. & Gonzáles, M. Efecto de la contaminación Microbiana y Oxidación Fenólica en el Establecimiento In vitro de frutas perennes. Cultivos tropicales. 2010; 31(4): 58-69. Available from: https://ediciones.inca.edu.cu/index.php/ediciones/article/view/78

18. Klein, E.Y., Van Boeckel, T.P., Martinez, E.M., Pant, S., Gandra, S. & Levin, S.A. Global increase and geographic convergence in antibiotic consumption between 2000 and 2015. Proceedings of the National Academy of Sciences. 2018; 115(15): 3463-70. Available from: http://dx.doi.org/10.1073/pnas.1717295115

19. Quetylas. F. & Azonzo J. Antibioticos β-lactamicos. En. Velásquez Farmacología Básica y Clínica. Madrid, España; 2015. ISBN: 978-84-9835-168-2. pp. 805-824. Available from: https://dialnet.unirioja.es/servlet/libro?codigo=312360

20. Castro, A. J. M. Estudio de la adsorción y degradación fotocatalítica de ácido nalidíxico con catalizador TiO2 Evonik P25. (Master Thesis internet). San Luis Potosí, México: Centro de Investigación y Estudios de Posgrado; 2023 (cited 2025 jul 18). Available from: https://repositorioinstitucional.uaslp.mx/xmlui/handle/i/8333

21. Martínez, F., Sigcha, E. & Toaquiza, P. Alternativa para la propagación in vitro de plátano variedad maqueño (Musa balbisiana AAB). Ciencia y Tecnología. 2008; 1(1): 43. Available from: https://doi.org/10.18779/cyt.v1i1.62

22. Fica, C. A. Resistencia antibiótica en bacilos Gram negativos, cocáceas Gram positivas y anaerobios. Implicancias terapéuticas. Revista Médica Clínica Las Condes. 2014; 25(3): 432-444. Available from: https://doi.org/10.1016/S0716-8640(14)70060-4

Cultivos Tropicales Vol. 47, No. 3, julio-septiembre 2026, ISSN: 1819-4087
 
Original article

Isolation and characterization of bacteria from tissue culture of Cenchrus purpureus CT-608

 

iDAmanda Abreu Cruz1Universidad Agraria de La Habana, A. Nacional, km 23 ½, San José de las Lajas, C.P. 32700, Mayabeque, Cuba

iDMaría Aurora Mesa Pérez1Universidad Agraria de La Habana, A. Nacional, km 23 ½, San José de las Lajas, C.P. 32700, Mayabeque, Cuba

iDMaibys Pérez Pérez1Universidad Agraria de La Habana, A. Nacional, km 23 ½, San José de las Lajas, C.P. 32700, Mayabeque, Cuba

iDMiriam Isidrón Pérez1Universidad Agraria de La Habana, A. Nacional, km 23 ½, San José de las Lajas, C.P. 32700, Mayabeque, Cuba

Andrés Raúl Hernández Montesinos2Instituto de Ciencia Animal, C. Central, km 47 ½, San José de las Lajas, Apartado Postal 24, Mayabeque, Cuba*✉:andresraulhm@gmail.com


1Universidad Agraria de La Habana, A. Nacional, km 23 ½, San José de las Lajas, C.P. 32700, Mayabeque, Cuba

2Instituto de Ciencia Animal, C. Central, km 47 ½, San José de las Lajas, Apartado Postal 24, Mayabeque, Cuba

 

*Author for correspondence: andresraulhm@gmail.com

Abstract

The objective of the present work consisted of reporting advances in the isolation and characterization of bacteria present in the tissue culture of Cenchrus purpureus CT-608. The study was developed in the Biotechnology Laboratory of the Agrarian University of Havana. Fragments of bacterial colonies from contaminated microplants were used and isolated in test tubes with Nutrient Agar medium. The colonies were described according to their macroscopic and microscopic characteristics through Gram staining and optical microscopy at 1000× magnification. The following descriptors were evaluated: cellular shape, size, grouping arrangement, reaction to Gram staining, cyst production, capsule production, endospore production. Bacterial sensitivity to the set of antibiotics was determined: Penicillin, Amoxicillin, Ampicillin, Cephalexin, Cefixime, Ceftriaxone, Nalidixic Acid, Gentamicin, and Chloramphenicol. Antibiotic response was assessed using the Kirby-Bauer technique. Two bacterial colonies were isolated, where one Gram-positive morphotype (MF1) and two Gram-negative morphotypes (MF2 and MF3) were obtained from one colony. The bacillary cellular form predominated, with a size of 3-4 mm, and the grouping arrangement varied from bacillus to irregular rosette-shaped. The morphotypes showed sensitivity to Nalidixic Acid and Cephalexin, and resistance to Penicillin, Amoxicillin, and Ampicillin. Three bacterial morphotypes with diverse morphological and physiological characteristics were isolated from C. purpureus CT-608 microplants. Their late appearance in the culture medium and their confinement around the explant indicate they may be endophytic microorganisms, an aspect that should be verified through chemotaxis.

Key words: 
colonies, endophytes, macroscopic and microscopic characteristics, morphotypes

Introduction

 

Plant tissue culture is a biotechnological method that allows the production of whole plants from fragments of plant organs and tissues established under controlled environmental conditions, with the absence of associated microorganisms, heterotrophic nutrition, and plastic or glass containers (11. Suárez, P. I. E. Prehistoria e historia del Cultivo de Tejidos Vegetales. En: Cultivo de Tejidos Vegetales. Suárez Padrón, I. E. (ed.). Ed. Colombia: Fondo Editorial Universidad de Córdoba; 2020. ISBN: 978-958-5104-09-9. pp 13-19. Available from: https://www.google.com/url?sa=t&source=web&rct=j&opi=89978449&url=https://repositorio.unicordoba.edu.co/entities/publication/800256e3-9997-4159-aae4-a0a2c5522852 ). Generally, the micropropagation technique is carried out under completely aseptic conditions; therefore, bacteria have often been described as contaminants that can cause plant tissue death by competing for nutrients and modifying the culture medium (22. El-Banna, A. N., El-Mahrouk, M. E., Dewir, Y. H., Farid, M. A., Abou Elyazid, D. M. & Schumacher, H. M. Endophytic Bacteria in Banana In Vitro Cultures: Molecular Identification, Antibiotic Susceptibility, and Plant Survival. Horticulturae. 2021; 7(12): 526. Available from: https://doi.org/10.3390/horticulturae7120526 ,33. Romadanova, N. V., Tolegen, A. B., Kushnarenko, S. V., Zholdybayeva, E. V. & Bettoni, J. C. Effect of Plant Preservative Mixture TM on Endophytic Bacteria Eradication from in Vitro-Grown Apple Shoots. Plants. 2022; 11(19): 2624. Available from: https://doi.org/10.3390/plants11192624 ). However, due to current knowledge about the benefits of endophytic microorganisms and associative bacteria in promoting growth and inducing stress tolerance, interest in their use has increased in some stages of micropropagation (44. Soumare, A., Diédhiou, A. G., Arora, N. K., Tawfeeq Al-Ani, L. K., Ngom, M., Fall, S., Hafidi, M., Ouhdouch, Y., Kouisni, L. & Sy, M.O. Potential Role and Utilization of Plant Growth Promoting Microbes in Plant Tissue Culture. Frontiers in Microbiology. 2021; 12: 649878. Available from: https://doi.org/10.3389/fmicb.2021.649878 ).

Cenchrus purpureus (Schumach.) Morrone, known as elephant grass, is cultivated throughout tropical and subtropical regions due to its high biomass accumulation potential, nutritional value, vigor, and persistence, making it a highly demanded forage for feeding ruminant species (55. Nguyen, B. T., Le, L. B., Pham, L. P., Nguyen, H. T., Tran, T. D. & Van Thai, N. The effects of biochar on the biomass yield of elephant grass (Pennisetum purpureum Schumach) and properties of acidic soils. Industrial Crops and Products. 2021; 161: 113224. Available from: https://doi.org/10.1016/j.indcrop.2020.113224 ). It has been reported that this plant has the potential to associate with plant growth-promoting microorganisms, including endophytic diazotrophic bacteria (66. Vander, P. A., de Andrade Lira, M., Machado, J. C., de Miranda Gomide, C. A., Martins, C. E., da Silva Lédo, F. J. & Daher, R. F. Elephantgrass, a tropical grass for cutting and grazing. Revista Brasileira de Ciencias Agrarias. 2021; 16(3): 1-13. Available from: https://doi.org/10.5039/agraria.v16i3a9317 ). In this regard, four bacterial genera have been isolated from the roots of this species: Sphingomonas, Bacillus, Pantoea, and Enterobacter, associated with the alleviation of salt stress and plant growth promotion (77. Li, X., Geng, X., Xie, R., Fu, L., Jiang, J., Gao, L. & Sun, J. The endophytic bacteria isolated from elephant grass (Pennisetum purpureum Schumach) promote plant growth and enhance salt tolerance of hybrid Pennisetum. Biotechnology for Biofuels. 2016; 9: 190. Available from: https://doi.org/10.1186/s13068-016-0592-0 ).

Currently, assays are being developed to optimize the micropropagation of C. purpureus CT-608 using segments of plants grown in vitro. As a first step, disinfection and in vitro establishment experiments were carried out, followed by studies to regenerate plantlets through direct organogenesis, during which bacteria associated with the microplants were found. In the consulted literature, research describing the genera and species of bacteria present in tissue culture of C. purpureus is scarce. Therefore, the objective of the following study is to report progress in the isolation and characterization of bacteria present in tissue culture of C. purpureus CT-608.

Materials and Methods

 

The following study was carried out at the plant tissue culture facilities of the Biotechnology Laboratory of the Faculty of Agronomy at the Agrarian University of Havana (UNAH), San José de las Lajas, Mayabeque, Cuba.

Biological material

 

This consisted of bacteria detected in C. purpureus CT-608 plantlets cultured in vitro, obtained from the second subculture in regeneration experiments. The plants were established in test tubes containing 15 mL of culture medium, under controlled conditions in a growth chamber with a photoperiod of 16 hours of light and 8 hours of darkness, relative humidity of 70 ± 5 %, light intensity of 45 μmol·m⁻²·s⁻¹, and temperature of 25 ± 2 °C.

Bacterial isolation

 

A fragment of the colony was extracted directly from the contaminated test tube and cultured in test tubes containing 15 mL of Nutrient Agar medium composed of 5.0 g L bacteriological peptone, 1.0 g L nutrient extract, 2.0 g L yeast extract, 5.0 g L sodium chloride, and 15.0 g L agar, with the pH adjusted to 5.7. After inoculation, the tubes were incubated for 48 hours at 30 ± 2 °C.

Description of bacterial colonies

 

Following isolation, macroscopic description was carried out visually, determining the shape, color, surface, and margin of the bacterial colonies according to Bergey's Manual of Bacteriology (88. Brenner, D. J., Staley, J. T. & Krieg, N. R. Classification of Procaryotic Organisms and the Concept of Bacterial Speciation. In: Brenner, D.J., Krieg, N.R., Staley, J.T., Garrity, G.M. (eds) Bergey’s Manual® of Systematic Bacteriology. Springer, Boston, MA; 2005. pp 27-32. Available from: https://doi.org/10.1007/0-387-28021-94 ). Subsequently, microscopic description was performed to determine colony morphology using Gram staining. The following descriptors were evaluated: cell shape, grouping pattern, size, reaction to Gram staining, cyst production, capsule production, and endospore production. Observations were made using an optical microscope at 1000X magnification.

Antibiogram

 

Bacterial sensitivity was determined using a set of antibiotics: Penicillin, Amoxicillin, Ampicillin, Cephalexin, Cefixime, Ceftriaxone, Nalidixic acid, Gentamicin, and Chloramphenicol. Antibiotic susceptibility was assessed using the Kirby‑Bauer disk diffusion method (99. Kirby, W. M. M., Bauer, A. W., Sherris, J. C. & Turck, M. Antibiotic susceptibility testing by a standardized single disk method. American Journal of Clinical Pathology. 1966; 45(4): 493-496. Available from: https://doi.org/10.1093/ajcp/45.4_ts.493 ). For this purpose, bacterial colonies subcultured on Petri dishes with Nutrient Agar medium were suspended until achieving a standard turbidity of 0.5 on the McFarland scale and incubated for 24 hours. After this period, five antibiotic‑impregnated disks were placed per plate, with a minimum separation of 24 mm to avoid interference, and incubated for 24 hours at 35 ± 2 °C. The inhibition zone diameter, including the disk, was measured in millimeters (mm) and compared with the EUCAST breakpoint table to classify bacteria as sensitive, intermediate, or resistant.

Results and Discussion

 

Two bacterial colonies were isolated, appearing approximately 30 days into the multiplication phase across multiple replicates of the C. purpureum in vitro culture. They always appeared separately in the test tubes, with their growth confined to the immediate vicinity of the explant without colonizing the rest of the medium. Nevertheless, their presence did not affect the development and growth of the microplants. This result could indicate that the microorganisms present are endophytic, thus withstanding the disinfection treatments applied to the explant.

The bacteria under study are shown in (Figure 1A and 1B). Initially, two colonies were isolated (Figure 1C and 1D), which differ from each other in their macroscopic characteristics (Table 1). Microscopic observation of the isolates revealed the presence of two bacterial morphotypes (MT) in Colony 1 and one morphotype in Colony 2. Colony 1 was purified using the streak plate method to separate the isolated bacterial morphotypes, which were designated as MT1 and MT2, and MT3 from Colony 2.

Microscopic characterization shows one Gram-positive morphotype (MT1) and two Gram-negative morphotypes (MT2 and MT3) (Figure 1E and 1F). Bacillary shape predominates, although MT3 exhibits a typical irregular, star-shaped form characteristic of the Phylum Firmicutes. No evidence of cysts, endospores, or capsules was found in any of the isolated morphotypes. All three morphotypes are catalase-positive, with a marked aerobic metabolism (Table 2).

Figure 1.  A. C. purpureus CT-608 microplants showing bacterial colony growth (MT1‑MT2). B. C. purpureus CT-608 microplants showing growth of bacterial colony MT3. C. Bacteria isolated on Nutrient Agar medium (MT1‑MT2). D. Bacteria isolated on Nutrient Agar medium (MT3). E. Microscopic characteristics of morphotypes MT1 and MT2. F. Microscopic characteristics of morphotype MT3
Table 1.  Macroscopic characteristics of bacterial morphotypes isolated on Nutrient Agar
Macroscopic characteristics Bacterial colonies
MF1 MF2 MF3
Common Medium size after 48 hours of growth. Circular shape with tendency toward irregularity. Diffuse elevation. Creamy texture. Catalase-positive.
Different Slightly undulate margin. Intense yellow color Slightly undulate margin. Light yellow color Entire margin. Intense orange color

Source: Prepared by the authors

Table 2.  Microscopic characteristics of the bacterial morphotypes isolated on Nutrient Agar medium
Microscopic characteristics Bacterial morphotypes
MF1 MF2 MF3
Cell shape bacillary bacillary bacillary
Size 3-4 mm 3-4 mm 3-4 mm
Grouping pattern bacillus bacillus irregular, star-shaped
Gram reaction + - -

Source: Prepared by the authors

The antibiogram showed sensitivity to nalidixic acid and cephalexin (Rocephin) for morphotypes MT1 and MT2, and resistance to penicillin, amoxicillin, and ampicillin. The assay could not be performed for MT3, as it did not grow after the first subculture, which prevented the application of antibiotic disks.

Some authors state that endophytic microorganisms develop part of their life cycle within a plant (1010. Pérez, A. F., Pérez, C. R. & Chamorro, C. M. Bacterias endófitas asociadas a cultivo de arroz con actividad antimicrobiana sobre Burkholderia glumae. Revista de la Asociación Colombiana de Ciencias Biológicas. 2013; 25: 31-40. Available from: https://doi.org/10.24188/recia.v4.n1.2012.306. ). Most colonize different compartments of the plant, such as the apoplast, including intercellular spaces of the cell walls and xylem vessels. On the other hand, some researchers report that disinfection methods do not always eliminate microorganism populations in in vitro tissues; many are capable of remaining latent in vascular bundles and are protected from chemical agents (1111. Chavarría, D. & López, G. Micropropagación de ápices caulinares en Plátano (Musa spp. AAB) cultivar Cuerno Gigante. (Doctoral Thesis Internet). Managua, Nicaragua: Universidad Nacional Agraria, UNA; 2010 (cited 2025 jul 18). Available from: https://repositorio.una.edu.ni/2138/1/tnf02c512m.pdf ). Furthermore, factors that may contribute to contamination include deficient explant disinfection, problems with culture medium sterilization, environmental contaminants, and deficiencies in sterile area handling.

The macroscopic and microscopic analyses performed to characterize the three bacterial morphotypes are of great importance. In the case of macroscopic analysis, it allows the determination of specific characteristics of the strains and constitutes the most common primary method for identifying colony phenotypes (1212. Bou, G., Fernández-Olmos, A., García, C., Sáez-Niet, J. A. & Valdezate, S. Métodos de identificación bacteriana en el laboratorio de microbiología. Enfermedades Infecciosas y Microbiología Clínica. 2011; 29(8): 601-608. Available from: https://doi.org/10.1016/j.eimc.2011.03.012 ). In this regard, some authors state that this method is based on observable macroscopic characteristics of colonies, such as size, colony type, texture, color, and appearance (1313. Mayea, S., Corone, M., Novo, R., Boado, I., Silveira, E., Soria, M. & Valiño, A. Microbiología Agropecuaria. Tomo II. Editorial Félix Varela. La Habana, Cuba; 2009. ISBN: 10-959-07-0576-6. pp 281. Available from: https://www.google.com/url?sa=t&source=web&rct=j&opi=89978449&url=https://www.isbncuba.ccl.cerlalc.org/catalogo.php%3Fmode%3Ddetalle%26nt%3D2567 ). On the other hand, microscopic analysis reveals key characteristics for bacterial identification, such as the cell wall type of the microorganism or the presence of distinctive structures.

Among these methods, Gram staining allows classification of bacteria based on differences in cell wall composition. Knowing whether bacteria are Gram-positive or Gram-negative enables appropriate measures to be taken to identify or even combat bacteria if they are pathogenic (1414. Yoshimura, J., Ogura, H. & Oda, J. Can Gram staining be a guiding tool for optimizing initial antimicrobial agents in bacterial infections?. Acute Medicine & Surgery. 2023; 10(1): e862. Available from: https://doi.org/10.1002/ams2.862.).

The optical microscope observation results determined the predominance of bacillary shape in the bacterial morphotypes. Bacterial cells can vary in shape and, accordingly, can be classified as cocci (spherical), bacilli (cylindrical, rod-shaped), spirilla (spiral or helical), and filaments (complex forms). Knowing cell shape provides information about survival, activity in the environment, and motility. In the case of bacilli, they have a larger surface area to volume ratio and can obtain nutrients more efficiently from dilute solutions (1515. Slonezewski, J. & Foster, J. Microbiology: An Evolving Science. Segunda Edición. Ed. W. W. Norton & Company, Estados Unidos; 2010. ISBN-10-0393934470. pp. 1097. Available from: https://www.google.com/url?sa=t&source=web&rct=j&opi=89978449&url=https://books.google.com/books/about/Microbiology.html%3Fid%3DDyK5RAAACAAJ ). Additionally, they produce and release hydrogen peroxide (H₂O₂) and lactic acid, which prevents the development of other bacterial and fungal forms (1616. Del Re, C. L., Rosenberg, C. E. & Madrid, V. G. Organismos procariotas y eucariotas. En: Biología celular y genética. Capítulo 3. Libros de Cátedra. Buenos Aires, Argentina: Universidad Nacional de La Plata (EDULP); 2025. ISBN: 978-950-34-2523-7. pp 36-49. Available from: https://sedici.unlp.edu.ar/bitstream/handle/10915/179578/Documento_completo.pdf?sequence=1 ).

The antibiogram showed sensitivity to nalidixic acid and cephalexin for morphotypes MT1 and MT2, and resistance to penicillin, amoxicillin, and ampicillin. The responses found in this assay are of great importance for designing disinfection strategies combined with nalidixic acid or cephalexin. Antibiotics are a subgroup of antimicrobials with antibacterial activity that cause the death or inhibit the growth of bacteria and fungi in culture media and in vitro grown plants (1717. Hernández, Y. & Gonzáles, M. Efecto de la contaminación Microbiana y Oxidación Fenólica en el Establecimiento In vitro de frutas perennes. Cultivos tropicales. 2010; 31(4): 58-69. Available from: https://ediciones.inca.edu.cu/index.php/ediciones/article/view/78 ). However, it is important to note that inappropriate use of antibiotics is the main driver of bacterial resistance (1818. Klein, E.Y., Van Boeckel, T.P., Martinez, E.M., Pant, S., Gandra, S. & Levin, S.A. Global increase and geographic convergence in antibiotic consumption between 2000 and 2015. Proceedings of the National Academy of Sciences. 2018; 115(15): 3463-70. Available from: http://dx.doi.org/10.1073/pnas.1717295115 ); therefore, it is important to use antibiotics responsibly and in combination with other control measures, such as proper sterilization of culture media, tools, and equipment.

Antibiotics such as nalidixic acid and ampicillin have effective activity against a broad spectrum of Gram-negative bacteria (1919. Quetylas. F. & Azonzo J. Antibioticos β-lactamicos. En. Velásquez Farmacología Básica y Clínica. Madrid, España; 2015. ISBN: 978-84-9835-168-2. pp. 805-824. Available from: https://dialnet.unirioja.es/servlet/libro?codigo=312360 ). Nalidixic acid is a quinolone that acts inside bacteria on DNA gyrase, an enzyme essential for DNA coiling and supercoiling, an action that prevents DNA replication and promotes its breakage (2020. Castro, A. J. M. Estudio de la adsorción y degradación fotocatalítica de ácido nalidíxico con catalizador TiO2 Evonik P25. (Master Thesis internet). San Luis Potosí, México: Centro de Investigación y Estudios de Posgrado; 2023 (cited 2025 jul 18). Available from: https://repositorioinstitucional.uaslp.mx/xmlui/handle/i/8333 ). On the other hand, penicillin, amoxicillin, and ampicillin inhibit reproduction and growth, and cause elongation and lysis of susceptible bacteria (2121. Martínez, F., Sigcha, E. & Toaquiza, P. Alternativa para la propagación in vitro de plátano variedad maqueño (Musa balbisiana AAB). Ciencia y Tecnología. 2008; 1(1): 43. Available from: https://doi.org/10.18779/cyt.v1i1.62 ).

There is a group of Gram-negative bacilli that possess enzymes conferring resistance to amoxicillin and ampicillin, as well as some first-generation cephalosporins. Second- and third-generation cephalosporins are stable against these enzymes and can therefore be used as an alternative treatment. Furthermore, resistance in some Gram-positive bacilli is predominantly associated with structural changes in the cell wall or cytosolic components such as ribosomes, rather than enzymatic mechanisms, making them resistant to penicillin or cephalosporins (2222. Fica, C. A. Resistencia antibiótica en bacilos Gram negativos, cocáceas Gram positivas y anaerobios. Implicancias terapéuticas. Revista Médica Clínica Las Condes. 2014; 25(3): 432-444. Available from: https://doi.org/10.1016/S0716-8640(14)70060-4 ).

Conclusions

 

Three bacterial morphotypes were isolated from C. purpureus CT-608 microplants, exhibiting diverse morphological and physiological characteristics. Among these, one Gram-positive morphotype (MT1) and two Gram-negative morphotypes (MT2 and MT3) were identified.

Bacillary shape predominates in MT1 and MT2, although MT3 exhibits a typical irregular, star-shaped form. No evidence of cysts, endospores, or capsules was found in any of the cases. All three morphotypes are catalase-positive, with a marked aerobic metabolism. The antibiogram showed sensitivity to nalidixic acid and cephalexin (Rocephin) for MT1 and MT2, and resistance to penicillin, amoxicillin, and ampicillin.

The late appearance of the bacterial morphotypes in the culture medium and their confinement around the explant suggest that they may be endophytic microorganisms. This aspect should be verified through chemotaxis techniques in subsequent assays.

Acknowledgments

 

The authors thank their colleagues at the Plant Biotechnology Laboratory of the Faculty of Agronomy, Agrarian University of Havana.